RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611848.1

SMAD4-217, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,648 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-217ENST00000611848 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 PTPRN2Q92932 1015 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 CCDC114Q96M63 670 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 PRSS16Q9NQE7 514 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 R4GN57 208 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 DMDP11532 3685 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 NUMA1Q14980 2115 aa8.96□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.96□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 PIEZO1Q92508 2521 aa8.96□□□□□ -0.97
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF487B1APH4 448 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 PROB1E7EW31 1015 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 HRO43593 1189 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SIN3BO75182 1162 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 TTC4O95801 387 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 MT-CO1P00395 513 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ITGAVP06756 1048 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 AMPD1P23109 780 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 GLDCP23378 1020 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ZBTB16Q05516 673 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SERINC3Q13530 473 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 AFMIDQ63HM1 303 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 CENPTQ96BT3 561 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 HMCESQ96FZ2 354 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SPACA7Q96KW9 195 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 CALN1Q9BXU9 219 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 CEP44Q9C0F1 390 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 KLC2Q9H0B6 622 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 LRRD1A4D1F6 860 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 NDC80O14777 642 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ALOX15BO15296 676 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 CD48P09326 243 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ACADMP11310 421 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 P2RY2P41231 377 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 MMP13P45452 471 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 MMRN1Q13201 1228 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 KAZNQ674X7 775 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 LINGO4Q6UY18 593 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 BBS12Q6ZW61 710 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 CEP68Q76N32 757 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 CCDC25Q86WR0 208 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 FAF2Q96CS3 445 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SERPINB12Q96P63 405 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 MTG2Q9H4K7 406 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 SCML1Q9UN30 329 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 PI4KAP42356 2102 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 K7ERQ8 282 aa8.94□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 DFFAO00273 331 aa8.94□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SMAD4-217ENST00000611848 RASGRF2O14827 1237 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms