RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 PLK5Q496M5 336 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 AP1ARQ63HQ0 302 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CYB5D1Q6P9G0 228 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF683Q8IZ20 524 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2I1PQ8NGU4 316 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 GAB3Q8WWW8 586 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CCT6BQ92526 530 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPH1Q92598 858 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PIGKQ92643 395 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 NUP85Q9BW27 656 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS16Q9NQE7 514 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PARVAQ9NVD7 372 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ERVW-1Q9UQF0 538 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 F9P00740 461 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 IL1R2P27930 398 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 COPAP53621 1224 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ECT2LQ008S8 904 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 STK40Q8N2I9 435 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC197Q8NCU1 140 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 C17orf50Q8WW18 174 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX19Q92543 992 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SIPA1Q96FS4 1042 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR174Q9BXC1 333 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TM6SF2Q9BZW4 377 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 KLC2Q9H0B6 622 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ANAPC7Q9UJX3 599 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CHUKO15111 745 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ALDH1A2O94788 518 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MIPP30301 263 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ACSL1P33121 698 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 IL31Q6EBC2 164 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC34Q8IZ02 419 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CAMKK1Q8N5S9 505 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CENPTQ96BT3 561 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 GABRG3Q99928 467 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM245Q9H330 911 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CAAP1Q9H8G2 361 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS51Q9UID3 782 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 DYTNA2CJ06 578 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM191CA6NGB0 347 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RIPK2O43353 540 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 LATS1O95835 1130 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 IL1BP01584 269 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PSMD8P48556 350 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ST8SIA6P61647 398 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ADCY2Q08462 1091 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP7D1Q3KQU3 841 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC73Q5JTD7 316 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 BRMS1LQ5PSV4 323 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 BNIPLQ7Z465 357 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR5BQ86VZ2 330 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RASSF3Q86WH2 238 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1958Q8N8K9 716 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP11CQ8NB49 1132 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 AZIN2Q96A70 460 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 EXOC2Q96KP1 924 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CNPY3Q9BT09 278 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SARDHQ9UL12 918 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RASGRF2O14827 1237 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 LRCH4O75427 683 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 VIMP08670 466 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RARAP10276 462 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 GOT1P17174 413 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 COILP38432 576 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPN9P43378 593 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TPMTP51580 245 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 DLG2Q15700 870 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MPP7Q5T2T1 576 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf118Q5T5N4 469 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PARP9Q8IXQ6 854 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ALG14Q96F25 216 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPA12BQ96MM6 686 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC2A11Q9BYW1 496 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PP55 124 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA8CPA6NN73 597 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MID1O15344 667 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 NEBLO76041 1014 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ACSL3O95573 720 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 AGTP01019 485 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R7Q15435 360 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms