RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL31Q6EBC2 164 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXL22Q6P050 247 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC39A13Q96H72 371 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UROC1Q96N76 676 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 S100A14Q9HCY8 104 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SUFUQ9UMX1 484 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TLR6Q9Y2C9 796 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TADA2AO75478 443 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APOA4P06727 396 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIRTP0C851 137 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAJB2P25686 324 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC12A2P55011 1212 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASPHQ12797 758 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MARC1Q5VT66 337 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COLGALT2Q8IYK4 626 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR13J1Q8NGT2 312 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD49Q8WVL7 239 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF21BQ96EK2 531 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POMKQ9H5K3 350 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCML2Q9UQR0 700 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.9□□□□□ -0.5
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A6NHS1 94 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFLARO15519 480 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OAZ2O95190 189 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MMP2P08253 660 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPAN8P19075 237 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GATMP50440 423 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DSC1Q08554 894 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKAA1Q13131 559 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SH2D4BQ5SQS7 431 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM171A1Q5VUB5 890 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF683Q8IZ20 524 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGBD5Q8N414 524 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SP110Q9HB58 689 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF186Q9NXI6 227 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.9□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DOCK4Q8N1I0 1966 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP3K13O43283 966 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CA12O43570 354 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINGO3P0C6S8 592 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC166P0CW27 439 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAMP19021 973 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACVRL1P37023 503 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RENBPP51606 427 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PKNOX1P55347 436 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INHBEP58166 350 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RASIP1Q5U651 963 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNX31Q8N9S9 440 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDM1BQ8NB78 822 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RDH11Q8TC12 318 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HDAC10Q969S8 669 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf74Q96LT6 269 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR62Q9BZJ7 368 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MID2Q9UJV3 735 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNC1P48547 511 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BTKQ06187 659 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAF10Q12962 218 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.89□□□□□ -0.51
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms