RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 RNF215Q9Y6U7 377 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 HEATR9A2RTY3 570 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CTAGE9A4FU28 777 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 YY2O15391 372 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 AHCYL1O43865 530 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 JAK2O60674 1132 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 FECHP22830 423 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 RPS6KA3P51812 740 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 VSNL1P62760 191 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 MTA1Q13330 715 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CCNJLQ8IV13 435 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 STARD8Q92502 1023 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CYP4F12Q9HCS2 524 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 FAM49BQ9NUQ9 324 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.91□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA6CA6NDK9 693 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 RAD51BO15315 384 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TBL1XO60907 577 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ANXA6P08133 673 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA6DP0CG33 693 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 MAGEA8P43361 318 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 RABIFP47224 123 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 MYL5Q02045 173 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 C1orf61Q13536 156 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TRIM29Q14134 588 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 NADK2Q4G0N4 442 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 FSCBQ5H9T9 825 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ALS2CLQ60I27 953 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SFR1Q86XK3 245 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TP53INP2Q8IXH6 220 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CRYBG2Q8N1P7 616 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 GPD1LQ8N335 351 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 C12orf29Q8N999 325 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CLIC6Q96NY7 704 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TAAR9Q96RI9 348 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CRACR2AQ9BSW2 395 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SLC29A3Q9BZD2 475 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SPRY4Q9C004 299 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa11.9□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 PDLIM1O00151 329 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 RFPL1O75677 317 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 YEATS4O95619 227 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 FESP07332 822 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 TSHRP16473 764 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 MYL6P60660 151 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ECT2LQ008S8 904 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 GUCY1B3Q02153 619 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 PTK2BQ14289 1009 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SURF1Q15526 300 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 BHLHA9Q7RTU4 235 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SPRED1Q7Z699 444 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 PHACTR4Q8IZ21 702 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 Q8NA96 180 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 PCDH19Q8TAB3 1148 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 MYEOVQ96EZ4 313 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 DDA1Q9BW61 102 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 GGT7Q9UJ14 662 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 APPL1Q9UKG1 709 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms