RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602251.5

LTBP4-231, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-231	ENST00000602251	MYO6	Q9UM54	1294 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	LMO7DN	F2Z398	122 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	FPGT	O14772	594 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	LIPC	P11150	499 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	HGF	P14210	728 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CR2	P20023	1033 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	GABRB2	P47870	512 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	NOMO3	P69849	1222 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	FMO1	Q01740	532 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	C1orf61	Q13536	156 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	PSMB7	Q99436	277 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	COX16	Q9P0S2	106 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	IL36A	Q9UHA7	158 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	YY2	O15391	372 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	SNAP91	O60641	907 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CLDN11	O75508	207 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	DAB1	O75553	588 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	LEFTY1	O75610	366 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	SLC2A3	P11169	496 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CHRNB2	P17787	502 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	RRM1	P23921	792 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	NOS2	P35228	1153 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	PFN3	P60673	137 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CYP4F2	P78329	520 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	KRT83	P78385	493 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CLCA4	Q14CN2	919 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	MANEA	Q5SRI9	462 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	AGPAT1	Q99943	283 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	STRADB	Q9C0K7	418 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	MUC3B	Q9H195	1237 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	DDIT4	Q9NX09	232 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	IFNK	Q9P0W0	207 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		18.74	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	LRRC53	A6NM62	1247 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	ANXA6	P08133	673 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	ADRB3	P13945	408 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	TNFAIP3	P21580	790 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CCR1	P32246	355 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	SCNN1A	P37088	669 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	NEK3	P51956	506 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	NME3	Q13232	169 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	SGCG	Q13326	291 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	ASIC2	Q16515	512 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	C2CD6	Q53TS8	623 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	VASH2	Q86V25	355 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	XYLT1	Q86Y38	959 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CLPB	Q9H078	707 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	RRN3	Q9NYV6	651 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	18.73	■□□□□ 0.59	4e-6	■□□□□ 9.6
LTBP4-231	ENST00000602251	VPS51	Q9UID3	782 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		18.73	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	IGLON5	A6NGN9	336 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CBFA2T2	O43439	604 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	AP1G1	O43747	822 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	CCL7	P80098	99 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	RNF214	Q8ND24	703 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	TBATA	Q96M53	351 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	LRRC61	Q9BV99	259 aa		18.72	■□□□□ 0.59
LTBP4-231	ENST00000602251	PISD	Q9UG56	409 aa		18.72	■□□□□ 0.59

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