RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 KCTD3Q9Y597 815 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 A0A0U1RQS6 177 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 AIM2O14862 343 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.039e-16■■■■■ 27
CTIF-205ENST00000587860 RXRGP48443 463 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 EFEMP1Q12805 493 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 NT5MQ9NPB1 228 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 CFLARO15519 480 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 SLC34A1Q06495 639 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 IHHQ14623 411 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 PSMD5Q16401 504 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 ZNF470Q6ECI4 717 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 SERINC5Q86VE9 423 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 KLHDC9Q8NEP7 349 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 HDAC11Q96DB2 347 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 SMIM14Q96QK8 99 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 FSD1LQ9BXM9 530 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 CROTQ9UKG9 612 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 BIRC5O15392 142 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 CDK4P11802 303 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 ALFQ53S48 1182 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 GRTP1Q5TC63 336 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 CNSTQ6PJW8 725 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 DEFB107AQ8IZN7 70 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 TMEM86AQ8N2M4 240 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 EXT2Q93063 718 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 NTAN1Q96AB6 310 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 CYP2S1Q96SQ9 504 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 TLK1Q9UKI8 766 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 GPR182O15218 404 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 SERPINA6P08185 405 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 GRIA2P42262 883 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 GRIA4P48058 902 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 DLG1Q12959 904 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 KRT72Q14CN4 511 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 KLHL35Q6PF15 583 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 SLC26A7Q8TE54 656 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 MYEOVQ96EZ4 313 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 MAFKO60675 156 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 PIGNO95427 931 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 SBK3P0C264 359 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 MX2P20592 715 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 SERPINB8P50452 374 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 CDH17Q12864 832 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 RABGAP1LQ5R372 815 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 ELMO2Q96JJ3 720 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 XPR1Q9UBH6 696 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.21■□□□□ 0.03
CTIF-205ENST00000587860 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ZNF195O14628 629 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 IRAK2O43187 625 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ARNTP27540 789 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TMED5Q9Y3A6 229 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 AK5Q9Y6K8 562 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD12Q6UB98 2062 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 A0A088AWK7 358 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SERPINB6P35237 376 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SLC1A2P43004 574 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 DSC2Q02487 901 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SCAPQ12770 1279 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CSHL1Q14406 222 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PHF21BQ96EK2 531 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SLC9A7Q96T83 725 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ACBD6Q9BR61 282 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 NEU3Q9UQ49 428 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 F9P00740 461 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PRSS56P0CW18 603 aa15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms