RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574085.5

TRPV1-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, human

TSL 2

Gene TRPV1, Length 2,644 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRPV1-208	ENST00000574085	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	SEPT8	Q92599	483 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	CCDC138	Q96M89	665 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRPV1-208	ENST00000574085	DLX3	O60479	287 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	RAD17	O75943	681 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	CLPX	O76031	633 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	DDHD2	O94830	711 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	LRPAP1	P30533	357 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	GRM3	Q14832	879 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ESX1	Q8N693	406 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	P2RY11	Q96G91	374 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	NANOG	Q9H9S0	305 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	SEPT3	Q9UH03	358 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	CPQ	Q9Y646	472 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ZNF487	B1APH4	448 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	MFSD11	O43934	449 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	NPR1	P16066	1061 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	GOT1	P17174	413 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	SQLE	Q14534	574 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	SPERT	Q8NA61	448 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	STYX	Q8WUJ0	223 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	MFSD3	Q96ES6	412 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	FANCE	Q9HB96	536 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	XPR1	Q9UBH6	696 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	DHRS12	A0PJE2	317 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	HACD1	B0YJ81	288 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ITGB3	P05106	788 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	PRKCB	P05771	671 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	PFKM	P08237	780 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	MMP10	P09238	476 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	CXCL8	P10145	99 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	RCVRN	P35243	200 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	GSS	P48637	474 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	OXA1L	Q15070	435 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ATP6AP1	Q15904	470 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ANO4	Q32M45	955 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	PERM1	Q5SV97	790 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	KCNMB4	Q86W47	210 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	HPS1	Q92902	700 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	RNF146	Q9NTX7	359 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	RIPK3	Q9Y572	518 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	EI24	O14681	340 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	UBD	O15205	165 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	B4GALT4	O60513	344 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	IL18RAP	O95256	599 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	NFIC	P08651	508 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	IDUA	P35475	653 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	PCYT1A	P49585	367 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	TMBIM6	P55061	237 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	SLC6A3	Q01959	620 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	PLCL1	Q15111	1095 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRPV1-208	ENST00000574085	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		12.82	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms