RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	TRIO	O75962	3097 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279		J3KR12	359 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	IL1B	P01584	269 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	LAMP2	P13473	410 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CDC25C	P30307	473 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MAGEA12	P43365	314 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ZP2	Q05996	745 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	KDELC1	Q6UW63	502 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PARM1	Q6UWI2	310 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	KCNMB4	Q86W47	210 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ISL2	Q96A47	359 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF778	Q96MU6	729 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	GCNA	Q96QF7	691 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	RBBP8	Q99708	897 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	KXD1	Q9BQD3	176 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MECR	Q9BV79	373 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NPHS2	Q9NP85	383 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	DONSON	Q9NYP3	566 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CDH7	Q9ULB5	785 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	EMCN	Q9ULC0	261 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF197	O14709	1029 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	COCH	O43405	550 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PMPCB	O75439	489 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TACR2	P21452	398 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	LIMK2	P53671	638 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PDE1B	Q01064	536 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	OVGP1	Q12889	678 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	BNIP1	Q12981	228 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PCID2	Q5JVF3	399 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	FYB2	Q5VWT5	728 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CES4A	Q5XG92	561 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CNPY4	Q8N129	248 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	AZIN2	Q96A70	460 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	COL4A3	Q01955	1670 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC78	A2IDD5	438 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	GLRA3	O75311	464 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	GSR	P00390	522 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PRKCG	P05129	697 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CKM	P06732	381 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	BPGM	P07738	259 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NEFH	P12036	1026 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	FCAR	P24071	287 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	RENBP	P51606	427 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	WNT3A	P56704	352 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TNK2	Q07912	1038 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	POU6F1	Q14863	301 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	C5orf22	Q49AR2	442 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	RANBP10	Q6VN20	620 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	DCLK2	Q8N568	766 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TEX26	Q8N6G2	289 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF398	Q8TD17	642 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	WBP2	Q969T9	261 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SP110	Q9HB58	689 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NT5M	Q9NPB1	228 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SNX15	Q9NRS6	342 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms