RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CD38	P28907	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ABCD1	P33897	745 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ACOT2	P49753	483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	RBP5	P82980	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	EXTL1	Q92935	676 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	WBP2	Q969T9	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM245	Q9H330	911 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SCML1	Q9UN30	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SCN1A	P35498	2009 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	OVOL3	O00110	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	KRIT1	O00522	736 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TRIM38	O00635	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CKMT1A	P12532	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CHKA	P35790	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CASR	P41180	1078 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	GALC	P54803	685 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MFAP3	P55082	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	NXPH1	P58417	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	GTF2B	Q00403	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	OVGP1	Q12889	678 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	STK3	Q13188	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MORC3	Q14149	939 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF234	Q14588	700 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	POSTN	Q15063	836 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF174	Q15697	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TBR1	Q16650	682 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SCFD1-223	ENST00000557076	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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