RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555227.1

LINC01578-205, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, human

TSL 5

Gene LINC01578, Length 1,078 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01578-205	ENST00000555227	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	BICD1	Q96G01	975 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	COG8	Q96MW5	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	PKP4	Q99569	1192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227		A0A0A0MQY5	61 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	TK1	P04183	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	PYGL	P06737	847 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	CXCR3	P49682	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	NAGS	Q8N159	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	LMX1B	O60663	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	CH25H	O95992	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	POLB	P06746	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	CHL1	O00533	1208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	SEPT4	O43236	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	CALCRL	Q16602	461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01578-205	ENST00000555227	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	STX16	O14662	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	IL1A	P01583	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	CYP21A2	P08686	494 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	ANOS1	P23352	680 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	DLG1	Q12959	904 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	CD101	Q93033	1021 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	TBATA	Q96M53	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	DERA	Q9Y315	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	HBP1	O60381	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	SERPINB2	P05120	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	CHN1	P15882	459 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC01578-205	ENST00000555227	CD53	P19397	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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