RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	TCEA3	O75764	348 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	LRIG2	O94898	1065 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	GJB6	O95452	261 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT10	P13645	584 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TSHR	P16473	764 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	RHOQ	P17081	205 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	ADRA1B	P35368	520 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	ETFB	P38117	255 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	MAPKAPK2	P49137	400 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	MYLK3	Q32MK0	819 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC14	Q49A88	953 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	MACC1	Q6ZN28	852 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	CLEC14A	Q86T13	490 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC185	Q8N715	623 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	MLKL	Q8NB16	471 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	NAT6	Q93015	286 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	COL26A1	Q96A83	441 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	BSN	Q9UPA5	3926 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	COL12A1	Q99715	3063 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	FLNC	Q14315	2725 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931		F8VZ95	297 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	RAMP2	O60895	175 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TM7SF2	O76062	418 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TMCC1	O94876	653 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFSF15	O95150	251 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	ANXA6	P08133	673 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	UCHL3	P15374	230 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	RPIA	P49247	311 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	YPEL5	P62699	121 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	CLN3	Q13286	438 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	PTK2B	Q14289	1009 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TCEA2	Q15560	299 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	FAXC	Q5TGI0	409 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TTC7B	Q86TV6	843 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	GPT2	Q8TD30	523 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TBATA	Q96M53	351 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	EPAS1	Q99814	870 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	KLC2	Q9H0B6	622 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGEH1	Q9H213	219 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	PADI4	Q9UM07	663 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	KDELR3	O43731	214 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	C6	P13671	934 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	MMP8	P22894	467 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	SDC4	P31431	198 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	HDAC4	P56524	1084 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	PPARD	Q03181	441 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	SPIDR	Q14159	915 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	IRF4	Q15306	451 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	ARL14	Q8N4G2	192 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	KY	Q8NBH2	561 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	GLMN	Q92990	594 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LETMD1-231	ENST00000551931	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		12.73	□□□□□ -0.37

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