RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SHC3Q92529 594 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 A6NHS1 94 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 TRIM13O60858 407 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PRKCAP17252 672 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 NPR3P17342 541 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEA2P43356 314 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 POLD2P49005 469 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ING4Q9UNL4 249 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 KPNA7A9QM74 516 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 PKP3Q9Y446 797 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ANXA9O76027 345 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 CERS5Q8N5B7 392 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3R3Q92569 461 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MTBPQ96DY7 904 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TTPALQ9BTX7 342 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.36□□□□□ -1.39
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