RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 ELOVL4Q9GZR5 314 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 NEUROG2Q9H2A3 272 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 AMACRQ9UHK6 382 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 CYTH4Q9UIA0 394 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 NFU1Q9UMS0 254 aa5.68□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 IPPQ9Y573 584 aa5.68□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 MYADML2A6NDP7 307 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 PER3P56645 1201 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF667Q5HYK9 610 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 HTR3DQ70Z44 454 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 C14orf80Q86SX3 495 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF480Q8WV37 535 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 PGBD4Q96DM1 585 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 DERAQ9Y315 318 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 C2CD2Q9Y426 696 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.66□□□□□ -1.5
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TRDN-205ENST00000546248 TMEM132DQ14C87 1099 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 MLC1Q15049 377 aa5.66□□□□□ -1.5
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