RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 BCL2L1Q07817 233 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 DEFB124Q8NES8 71 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 CXorf40AQ8TE69 158 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 AMACRQ9UHK6 382 aa24.52■■□□□ 1.52
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TOR1BO14657 336 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SLC31A1O15431 190 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TRIM16O95361 564 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 GRK6P43250 576 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 ARSEP51690 589 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 NXPH1P58417 271 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 BNC1Q01954 994 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 MARC1Q5VT66 337 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 DBX2Q6ZNG2 339 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TMEM145Q8NBT3 493 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 FATE1Q969F0 183 aa24.51■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 A0A1B0GTQ1 180 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TSPAN11A1L157 253 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 A6NNZ2 444 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SPOPO43791 374 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 NEBLO76041 1014 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 KRT10P13645 584 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 IL4RP24394 825 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 GKP32189 559 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 FAF2Q96CS3 445 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 EXOC2Q96KP1 924 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 CACNA1AO00555 2505 aa24.5■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 FPGTO14772 594 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 AREL1O15033 823 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 KDELR1P24390 212 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 CDC25BP30305 580 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 RXRGP48443 463 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 UGP2Q16851 508 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 OR2I1PQ8NGU4 316 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 IFT43Q96FT9 208 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa24.49■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 CFAP69A5D8W1 941 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 MAFKO60675 156 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SOCS5O75159 536 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TM7SF2O76062 418 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 CCNCP24863 283 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 MMP13P45452 471 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 RABIFP47224 123 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SCNN1BP51168 640 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TAS2R40P59535 323 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 DNAH14Q0VDD8 3507 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 GALNT2Q10471 571 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 NDUFAF2Q8N183 169 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 RHBDD1Q8TEB9 315 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 NUDCD1Q96RS6 583 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SCUBE2Q9NQ36 999 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 ETNK2Q9NVF9 386 aa24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 PLXNA2O75051 1894 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 LRRD1A4D1F6 860 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 H0Y8X5 98 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 PSTPIP1O43586 416 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SH3BP5O60239 455 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 WNT1P04628 370 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 ITGAVP06756 1048 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 THEGLP0DJG4 465 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 CA4P22748 312 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 FECHP22830 423 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 ABL2P42684 1182 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 MMRN1Q13201 1228 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TMEM52BQ4KMG9 183 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 GLRX5Q86SX6 157 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 SPOCK2Q92563 424 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 TSGA13Q96PP4 275 aa24.47■■□□□ 1.51
PITX3-202ENST00000539804 MGME1Q9BQP7 344 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms