RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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PTPRB-204ENST00000538708 AMZ1Q400G9 498 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRB-204ENST00000538708 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CASP12Q6UXS9 341 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 KRT73Q86Y46 540 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRB-204ENST00000538708 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 S100A13Q99584 98 aa9.53□□□□□ -0.88
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