RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528999.5

PUF60-213, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-213	ENST00000528999	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	MAFF	Q9ULX9	164 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	VWA7	Q9Y334	891 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999		F5H5T6	163 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999		J3KR12	359 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ACSL4	O60488	711 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	NBN	O60934	754 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CNTN5	O94779	1100 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	PSMG1	O95456	288 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	INHA	P05111	366 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	GM2A	P17900	193 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	TACR2	P21452	398 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	OR1E1	P30953	314 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CPOX	P36551	454 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ETFB	P38117	255 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	VHL	P40337	213 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CD86	P42081	329 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	SLC1A2	P43004	574 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	GRIA4	P48058	902 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	GPR15	P49685	360 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CDH4	P55283	916 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ACTR3	P61158	418 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ITK	Q08881	620 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	HERC3	Q15034	1050 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	PSMD5	Q16401	504 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ALF	Q53S48	1182 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	TMC7	Q7Z402	723 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	MAVS	Q7Z434	540 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	IGSF8	Q969P0	613 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	PLD4	Q96BZ4	506 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ASB2	Q96Q27	587 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	TCF12	Q99081	682 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	OMD	Q99983	421 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ILVBL	A1L0T0	632 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	KDELR3	O43731	214 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	DLX3	O60479	287 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	TLR5	O60602	858 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ENTPD5	O75356	428 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CLDN11	O75508	207 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	LATS1	O95835	1130 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CXCL10	P02778	98 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	SBK3	P0C264	359 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ARRB2	P32121	409 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	TAS2R39	P59534	338 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	MXRA7	P84157	204 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	IRF9	Q00978	393 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CAP1	Q01518	475 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	PFKP	Q01813	784 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	KDSR	Q06136	332 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	BTK	Q06187	659 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CTBP1	Q13363	440 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	GPNMB	Q14956	572 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	DLG2	Q15700	870 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CCDC6	Q16204	474 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	USP41	Q3LFD5	358 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	TPGS2	Q68CL5	300 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CHST9	Q7L1S5	443 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	MFN1	Q8IWA4	741 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PUF60-213	ENST00000528999	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		10.78	□□□□□ -0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms