RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC7A5Q01650 507 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNJ11Q14654 390 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TPSAB1Q15661 275 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 FAXCQ5TGI0 409 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 HOOK3Q86VS8 718 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 BBOF1Q8ND07 529 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 OR2T3Q8NH03 318 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 CPT1BQ92523 772 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 WHRNQ9P202 907 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PQ67 120 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 E7EVH7 732 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 FZD6O60353 706 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 LEFTY1O75610 366 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 ITIH2P19823 946 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 GKP32189 559 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 ADRA1AP35348 466 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 DGKEP52429 567 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 WNT3AP56704 352 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 RANBP10Q6VN20 620 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 FLCNQ8NFG4 579 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIB3Q96RU7 358 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 UBP1Q9NZI7 540 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 DKK3Q9UBP4 350 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TP73O15350 636 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 PMPCBO75439 489 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 COPAP53621 1224 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 MORF4L2Q15014 288 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 ARSIQ5FYB1 569 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TEX35Q5T0J7 233 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 FEM1CQ96JP0 617 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TSPAN11A1L157 253 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM221A6NGB7 291 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 F5H423 210 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 M0R296 226 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 PRLP01236 227 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 AOC1P19801 751 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 COL9A1P20849 921 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 CLCN5P51795 746 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 GUCY2DQ02846 1103 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 CDK18Q07002 472 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAF2Q12933 501 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 LINC00523Q86TU6 105 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 MCUQ8NE86 351 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 IPMKQ8NFU5 416 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 SARDHQ9UL12 918 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX24Q9Y343 169 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-205ENST00000528462 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 PGLSO95336 258 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 PIGNO95427 931 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT2B4P06133 528 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 SATB1Q01826 763 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBTB16Q05516 673 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 UBXN4Q92575 508 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 RUBCNQ92622 972 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-205ENST00000528462 NDST3O95803 873 aa22.19■■□□□ 1.14
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