RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 AP1S1P61966 158 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT3Q14435 633 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 AVILO75366 819 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 ANXA9O76027 345 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 IL1BP01584 269 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 CSNK1DP48730 415 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SEMG2Q02383 582 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 BCL2L1Q07817 233 aa22.96■■□□□ 1.27
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TSNARE1-208ENST00000524325 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0U1RQS6 177 aa22.95■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.95■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 NCOR1O75376 2440 aa22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 NPC1O15118 1278 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 TPH1P17752 444 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMD8P48556 350 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC32Q14392 662 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 PLPP6Q8IY26 295 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.94■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 PIRTP0C851 137 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 ITIH2P19823 946 aa22.94■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 DENND2CQ68D51 928 aa22.94■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC14L1Q92503 715 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 NELL2Q99435 816 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 CD248Q9HCU0 757 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 GDF3Q9NR23 364 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 BANF1O75531 89 aa22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 COPAP53621 1224 aa22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 RAD51Q06609 339 aa22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 CDK18Q07002 472 aa22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 STARD3Q14849 445 aa22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF534Q76KX8 674 aa22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 IFT43Q96FT9 208 aa22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIB3Q96RU7 358 aa22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.93■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 CTPS1P17812 591 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 CES1P23141 567 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 SERPINA4P29622 427 aa22.92■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.269e-8■■■□□ 16.5
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TSNARE1-208ENST00000524325 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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TSNARE1-208ENST00000524325 VPS45Q9NRW7 570 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 NFU1Q9UMS0 254 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 A8MX80 341 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 MYBL2P10244 700 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 SATB1Q01826 763 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-208ENST00000524325 ART4Q93070 314 aa22.92■■□□□ 1.26
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