RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 LMO1P25800 156 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PNPLA4P41247 253 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SLC11A2P49281 568 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 NHLH1Q02575 133 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 OCA2Q04671 838 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 POSTNQ15063 836 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 NPY5RQ15761 445 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 UGCGQ16739 394 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TCTN1Q2MV58 587 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 HYIQ5T013 277 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 FUT10Q6P4F1 479 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CUEDC2Q9H467 287 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MAGEF1Q9HAY2 307 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TBC1D7Q9P0N9 293 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 DKK2Q9UBU2 259 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 EXOC7Q9UPT5 735 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 POM121BA6NF01 834 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 OR6C75A6NL08 312 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MARCH11A6NNE9 402 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ZAR1LA6NP61 321 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 M0QYG6 137 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM24O15164 1050 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 LRP3O75074 770 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 VPS4BO75351 444 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RECQL4O94761 1208 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SUN1O94901 812 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 STBD1O95210 358 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 KCNE1P15382 129 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 AOC1P19801 751 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CHRM3P20309 590 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 FGFR4P22455 802 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJB1P25685 340 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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HDAC2-216ENST00000523628 NBL1P41271 181 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 DPP6P42658 865 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 OR1G1P47890 313 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SLC11A1P49279 550 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF134P52741 427 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 STK3Q13188 491 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PMS2P11Q13670 270 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CAPSQ13938 189 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MORC3Q14149 939 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MYBPC2Q14324 1141 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 VEPH1Q14D04 833 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PPM1LQ5SGD2 360 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ATF7IP2Q5U623 682 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ATL3Q6DD88 541 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF280DQ6N043 979 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SYCE2Q6PIF2 218 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ITIH5Q86UX2 942 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 OR2C3Q8N628 320 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC138Q96M89 665 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 GCNAQ96QF7 691 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 APOL6Q9BWW8 343 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TOR3AQ9H497 397 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ASB7Q9H672 318 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRHQ9HD43 1115 aa4.5□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
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