RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 MFAP3P55082 362 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 BCAR1P56945 870 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 IFITM3Q01628 133 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 CDK18Q07002 472 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 CYP24A1Q07973 514 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM126BQ8IUX1 230 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 AGR3Q8TD06 166 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 HPDLQ96IR7 371 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R36Q96LQ0 422 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 UROC1Q96N76 676 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 DOK1Q99704 481 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 RNF38Q9H0F5 515 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 IFT52Q9Y366 437 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF236Q9UL36 1845 aa10.21□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 H7C4K7 107 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 JRKO75564 520 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ODC1P11926 461 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 DCKP27707 260 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 WDR5P61964 334 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 NFIL3Q16649 462 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 INAVAQ3KP66 663 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 LIN9Q5TKA1 542 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 FAM171A1Q5VUB5 890 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 MBLAC2Q68D91 279 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 JADE1Q6IE81 842 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 SLC26A11Q86WA9 606 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 WDR49Q8IV35 697 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TDHQ8IZJ6 230 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 UBR7Q8N806 425 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 LILRB4Q8NHJ6 448 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 HM13Q8TCT9 377 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 SORT1Q99523 831 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 CGRRF1Q99675 332 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 OLFM1Q99784 485 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 SH3GL1Q99961 368 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 MOSPD1Q9UJG1 213 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TRAF6Q9Y4K3 522 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 CLOCKO15516 846 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 KRT75O95678 551 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 IGHA2P01877 340 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 BMPR1AP36894 532 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TNFSF9P41273 254 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 SHHQ15465 462 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 NEDD8Q15843 81 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM240Q5SV17 173 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF697Q5TEC3 545 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf74Q86VG3 221 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TTC30AQ86WT1 665 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 OR7G1Q8NGA0 311 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 FAM110BQ8TC76 370 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TMC2Q8TDI7 906 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 PI4K2AQ9BTU6 479 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 MROQ9BYG7 248 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 PALMDQ9NP74 551 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087WXM4 84 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ARL5CA6NH57 179 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF623O75123 536 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ITGAVP06756 1048 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 HPCAL1P37235 193 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 OPRL1P41146 370 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 SNX32Q86XE0 403 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 ELMOD1Q8N336 334 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TTC39CQ8N584 583 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 EGLN2Q96KS0 407 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 RTKNQ9BST9 563 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 POLE4Q9NR33 117 aa10.2□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 GMNNO75496 209 aa10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 RPL9P32969 192 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 SNX16P57768 344 aa10.19□□□□□ -0.78
TRPS1-211ENST00000520276 TNK2Q07912 1038 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms