RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
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SH3BP2-225ENST00000513069 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2-225ENST00000513069 MACROD2A1Z1Q3 448 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2-225ENST00000513069 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2-225ENST00000513069 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2-225ENST00000513069 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2-225ENST00000513069 PRKCGP05129 697 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2-225ENST00000513069 CD59P13987 128 aa15.33■□□□□ 0.04
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SH3BP2-225ENST00000513069 MX2P20592 715 aa15.33■□□□□ 0.04
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