RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC6Q86X45 466 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF573Q86YE8 665 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 BATF2Q8N1L9 274 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SLC15A4Q8N697 577 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ANKFN1Q8N957 763 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MCPH1Q8NEM0 835 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MITD1Q8WV92 249 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CPT1BQ92523 772 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC51Q96ER9 411 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MAGED4Q96JG8 741 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 DGAT2Q96PD7 388 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 FIZ1Q96SL8 496 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MMP19Q99542 508 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ZMAT4Q9H898 229 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 C8orf4Q9NR00 106 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PNPOQ9NVS9 261 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 IL37Q9NZH6 218 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 A0A087WZY1 265 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM210A6NLX4 147 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF185O15231 689 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ATP6V1G1O75348 118 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SCGB2A1O75556 95 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINI2O75830 405 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 AREGP15514 252 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CHN1P15882 459 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NPR1P16066 1061 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ADRA1DP25100 572 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 GPD2P43304 727 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ALDH3B1P43353 468 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 GUCY1B3Q02153 619 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 DYRK1AQ13627 763 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 HERC3Q15034 1050 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NR0B2Q15466 257 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NADK2Q4G0N4 442 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 OR6B3Q8NGW1 331 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 STK35Q8TDR2 534 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NRG4Q8WWG1 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PIGKQ92643 395 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 C5orf30Q96GV9 206 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CGREF1Q99674 301 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ANO3Q9BYT9 981 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 RNF32Q9H0A6 362 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 KLC2Q9H0B6 622 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 VCX2Q9H322 139 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.36□□□□□ -1.23
PDCD4-211ENST00000498367 SENP1Q9P0U3 644 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms