RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1B0GVT2	93 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	VWA5A	O00534	786 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	RGS14	O43566	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP2C2	O75185	946 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CD4	P01730	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HEXA	P06865	529 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	TFPI	P10646	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SRD5A1	P18405	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	EDN2	P20800	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	POU1F1	P28069	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CDC25A	P30304	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ARRB2	P32121	409 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CXCR3	P49682	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	EFNA5	P52803	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CLDN2	P57739	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CES5A	Q6NT32	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CBSL	P0DN79	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	PCNA	P12004	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	MYF6	P23409	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CBS	P35520	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNJ4	P48050	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HNF4G	Q14541	408 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1W2PQM1	296 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ASAP2	O43150	1006 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	TNFSF14	O43557	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ITM2A	O43736	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SOX30	O94993	753 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	NTN1	O95631	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	TBX18	O95935	607 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	NAGA	P17050	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ABCD1	P33897	745 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ABAT	P80404	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HSPB2	Q16082	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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