RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	RFFL	Q8WZ73	363 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	KLK6	Q92876	244 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MYOC	Q99972	504 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246		J3KR12	359 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFSF14	O43557	240 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	GJB3	O75712	270 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CD160	O95971	181 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	HTR1B	P28222	390 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS2R38	P59533	333 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CYTH1	Q15438	398 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF284	Q2VY69	593 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	LAYN	Q6UX15	382 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	IL21R	Q9HBE5	538 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		11.46	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PR77	199 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRD1	A4D1F6	860 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLON5	A6NGN9	336 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNK3	O14649	394 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	GIPC1	O14908	333 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	IL1R2	P27930	398 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	GK	P32189	559 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CETN2	P41208	172 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	MMP13	P45452	471 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	RXRG	P48443	463 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	BLK	P51451	505 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	11.45	□□□□□ -0.58	1e-9	■■■□□ 14.9
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM193A	P78312	1265 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	IL9R	Q01113	521 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	UGP2	Q16851	508 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	AFMID	Q63HM1	303 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZSR6	202 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	GLRX5	Q86SX6	157 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CHP1	Q99653	195 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PDF	Q9HBH1	243 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SOCS5	O75159	536 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PIGN	O95427	931 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ELFN1	P0C7U0	828 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PML	P29590	882 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	EPHB1	P54762	984 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	YPEL5	P62699	121 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SHC2	P98077	582 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	DAB2	P98082	770 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF7	Q14155	803 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC14	Q15048	493 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	ARTN	Q5T4W7	220 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	PARG	Q86W56	976 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	GLMN	Q92990	594 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58

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