RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DYTNA2CJ06 578 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX22C9J3V5 150 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIMM23O14925 209 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNJ13O60928 360 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FCGR1AP12314 374 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPD2P43304 727 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCT5P48643 541 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFATC4Q14934 902 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLCB4Q15147 1175 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCAF6Q58WW2 860 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FJX1Q86VR8 437 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL25Q9H293 177 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GGA3Q9NZ52 723 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLRF2D3W0D1 207 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACOT8O14734 319 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 URODP06132 367 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPN2P17706 415 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNTFP26441 200 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLCN5P51795 746 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLDN2P57739 230 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TLE2Q04725 743 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAF12Q16514 161 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF766Q5HY98 468 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARMC9Q7Z3E5 817 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AADATQ8N5Z0 425 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLD5Q8N7P1 536 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYRIPQ8NFW9 859 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMED6Q8WW62 240 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIB2Q92519 343 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNAPC3Q92966 411 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR63Q9BZJ6 419 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PEMTQ9UBM1 199 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0U1RQF3 1178 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC01553A4QN01 128 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSPB2A8KAH6 182 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERVV-2B6SEH9 535 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRSS44E7EML9 344 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERPINI2O75830 405 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VNN2O95498 520 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLBP06746 335 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TGFB3P10600 412 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFPIP10646 304 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT10P13645 584 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGAXP20702 1163 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGM1P36871 562 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP10-5P60370 271 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HYAL1Q12794 435 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TDGQ13569 410 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSPB2Q16082 182 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFIL3Q16649 462 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRSS57Q6UWY2 283 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM160B2Q86V87 743 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TXNDC15Q96J42 360 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FIZ1Q96SL8 496 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RRN3Q9NYV6 651 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR6C3Q9NZP0 311 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0U1RQJ8 604 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLK8O60259 260 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP2C2O75185 946 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC2A4P14672 509 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EDN2P20800 178 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ART1P52961 327 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR1H2P55055 460 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDH15P55291 814 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms