RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 FAM3CQ92520 227 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 MTG2Q9H4K7 406 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 CHKBQ9Y259 395 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.27■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 EGFP01133 1207 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF534Q76KX8 674 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 PLPP6Q8IY26 295 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CHPFQ8IZ52 775 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 FEM1CQ96JP0 617 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CASS4Q9NQ75 786 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 BFARQ9NZS9 450 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ANTXRLA6NF34 631 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 WASH3PC4AMC7 463 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 BANF1O75531 89 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 PIGNO95427 931 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 IL12RB1P42701 662 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 GRM3Q14832 879 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SLC1A5Q15758 541 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 MSS51Q4VC12 460 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 DENND2CQ68D51 928 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 RANBP10Q6VN20 620 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CHST14Q8NCH0 376 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 PTPRN2Q92932 1015 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CAVIN3Q969G5 261 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 RMDN1Q96DB5 314 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 HEPHQ9BQS7 1158 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM245Q9H330 911 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SUN2Q9UH99 717 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CA14Q9ULX7 337 aa22.26■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 EPOP01588 193 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 EPHX1P07099 455 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.156e-7■■□□□ 13.2
PSPC1-204ENST00000492741 TPH1P17752 444 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CD72P21854 359 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SERPINA4P29622 427 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CHRNA4P43681 627 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 C2orf27AQ580R0 203 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CASC4Q6P4E1 433 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ACOX2Q99424 681 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.25■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 COL6A3P12111 3177 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 MAN2B1O00754 1011 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 NPC1O15118 1278 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 NDST3O95803 873 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 MGAT1P26572 445 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 WASP42768 502 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 MAGEA4P43358 317 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 PMS2P54278 862 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 EPHB1P54762 984 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 TRAF2Q12933 501 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 GALNT3Q14435 633 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CFAP58Q5T655 872 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SDE2Q6IQ49 451 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.24■■□□□ 1.15
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PSPC1-204ENST00000492741 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 HCN2Q9UL51 889 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.24■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 HLA-DPA1P20036 260 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 PRKCHP24723 683 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 MAGEA3P43357 314 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 NPY2RP49146 381 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 C9orf72Q96LT7 481 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ASB2Q96Q27 587 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 IL36AQ9UHA7 158 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 E7ESA3 106 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SOCS5O75159 536 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CPP00450 1065 aa22.23■■□□□ 1.15
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