RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 IFT20Q8IY31 132 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 UBXN4Q92575 508 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PTPRN2Q92932 1015 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SNF8Q96H20 258 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FEM1CQ96JP0 617 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 EXOC2Q96KP1 924 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 L2HGDHQ9H9P8 463 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 HACD3Q9P035 362 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 DKK3Q9UBP4 350 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 LHX3Q9UBR4 397 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TTC28Q96AY4 2481 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 NUP205Q92621 2012 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC72A6NJI9 287 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFS2O75306 463 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PMPCBO75439 489 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 LEFTY1O75610 366 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CRTAMO95727 393 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PEX11BO96011 259 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CPP00450 1065 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FGF1P05230 155 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 UGT2B4P06133 528 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ITGB7P26010 798 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SLC8A1P32418 973 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PSMD8P48556 350 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SATB1Q01826 763 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 DSC2Q02487 901 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ARHGEF7Q14155 803 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MORF4L2Q15014 288 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CST6Q15828 149 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PCSK7Q16549 785 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ARSIQ5FYB1 569 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 JAMLQ86YT9 394 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 STK40Q8N2I9 435 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 IPMKQ8NFU5 416 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 HMGB4Q8WW32 186 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 RUBCNQ92622 972 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MYO19Q96H55 970 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ERP44Q9BS26 406 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CEP41Q9BYV8 373 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TRABDQ9H4I3 376 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 NOD2Q9HC29 1040 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 RAD18Q9NS91 495 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 BFARQ9NZS9 450 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FZD4Q9ULV1 537 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 COL4A2P08572 1712 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CHD5Q8TDI0 1954 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 MAGEB16A2A368 324 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 C2orf81A6NN90 581 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 TTI1O43156 1089 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 MAP3K13O43283 966 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 AP2A1O95782 977 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 NDST3O95803 873 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CD160O95971 181 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CR2P20023 1033 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 TPSB2P20231 275 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 PSMB4P28070 264 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 HOXA6P31267 233 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 VPS41P49754 854 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 GDF10P55107 478 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 WNT3AP56704 352 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 MESP2Q0VG99 397 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-210ENST00000486889 CDH17Q12864 832 aa9.83□□□□□ -0.84
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