RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261		A0A087X0B3	334 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261		H3BM21	787 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	HSF2BP	O75031	334 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	GJB3	O75712	270 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	CALB1	P05937	261 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	FMO5	P49326	533 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	NNT	Q13423	1086 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	NKD1	Q969G9	470 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	CCT7	Q99832	543 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	DRC3	Q9H069	523 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KRIT1-222	ENST00000486261	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	POM121B	A6NF01	834 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261		F8W8V4	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ABLIM1	O14639	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TPP1	O14773	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	EPHX1	P07099	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CLU	P10909	449 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CHRNB1	P11230	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GZMA	P12544	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LCP1	P13796	627 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CD72	P21854	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ALAS2	P22557	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TNFSF4	P23510	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	S100A5	P33763	92 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CD86	P42081	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NDUFA8	P51970	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	STK4	Q13043	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NAB2	Q15742	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	STX1A	Q16623	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	POLH	Q9Y253	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	WNT7A	O00755	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	APOL1	O14791	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GOSR1	O95249	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PGM3	O95394	542 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SDC4	P31431	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MATK	P42679	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SGCG	Q13326	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF77	Q15935	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LPAL2	Q16609	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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