RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 DKK3Q9UBP4 350 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 MYO6Q9UM54 1294 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SMTNL1A8MU46 457 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TOR1BO14657 336 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 AREL1O15033 823 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 BRINP1O60477 761 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 GIMD1P0DJR0 217 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 RPIAP49247 311 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TYRO3Q06418 890 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 NCAPHQ15003 741 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ASIC2Q16515 512 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 FAXCQ5TGI0 409 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 NETO2Q8NC67 525 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 IFI44Q8TCB0 444 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 EXOC2Q96KP1 924 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SPEGQ15772 3267 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 KNTC1P50748 2209 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CPED1A4D0V7 1026 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ANXA6P08133 673 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 MYF5P13349 255 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ATP1A3P13637 1013 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 NDST2P52849 883 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 NR0B2Q15466 257 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ERAP2Q6P179 960 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CENPTQ96BT3 561 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 KLC2Q9H0B6 622 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TPP1O14773 563 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TIMP2P16035 220 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 HTR1BP28222 390 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 BLKP51451 505 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CYTH1Q15438 398 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CDKN3Q16667 212 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 LSMEM2Q8N112 164 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SP110Q9HB58 689 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ACACAQ13085 2346 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ZZEF1O43149 2961 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SPINT1O43278 529 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PRPSAP2O60256 369 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CSO75390 466 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PALMO75781 387 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PIGNO95427 931 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CTSEP14091 401 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 IGFALSP35858 605 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 OGDHQ02218 1023 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PPARDQ03181 441 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 MAMLD1Q13495 774 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 LRRC14Q15048 493 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 MACC1Q6ZN28 852 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ATL2Q8NHH9 583 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 LHX3Q9UBR4 397 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 KLF15Q9UIH9 416 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.36■□□□□ 0.85
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