RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 VOPP1Q96AW1 172 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 DONSONQ9NYP3 566 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 APC2O95996 2303 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 NEMP2A6NFY4 417 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 AREL1O15033 823 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 NRDCO43847 1150 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PBX1P40424 430 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 MAMLD1Q13495 774 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 FZD2Q14332 565 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 EXOC2Q96KP1 924 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1W2PQC6 194 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 RNF8O76064 485 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 CSF2P04141 144 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 GIMD1P0DJR0 217 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 NDST2P52849 883 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 E2F1Q01094 437 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 VPS36Q86VN1 386 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 RFFLQ8WZ73 363 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 LRRC19Q9H756 370 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PDFQ9HBH1 243 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 DKK3Q9UBP4 350 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 LHX3Q9UBR4 397 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ACACAQ13085 2346 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ADAMTS20P59510 1910 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 K7ESM1 405 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 SCAMP1O15126 338 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 INSIG1O15503 277 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 DAPK3O43293 454 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PRPSAP2O60256 369 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PRAMEF11O60813 436 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 MMP20O60882 483 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 NEBLO76041 1014 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 TM7SF2O76062 418 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PIGNO95427 931 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 CKMT1AP12532 417 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 IGFALSP35858 605 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PRKCIP41743 596 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 THOP1P52888 689 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PFN3P60673 137 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ELP6Q0PNE2 266 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 CYTH1Q15438 398 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 CA9Q16790 459 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 CFAP58Q5T655 872 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF653Q96CK0 615 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM11Q96F44 468 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 APOLD1Q96LR9 279 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PEBP4Q96S96 227 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms