RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa11□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 PTPN13Q12923 2485 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 NEMP2A6NFY4 417 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 LMO7DNF2Z398 122 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 J3QKU1 62 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 FPGTO14772 594 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 TPP1O14773 563 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 TSPAN6O43657 245 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 GSRP00390 522 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 RHOQP17081 205 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 CCL7P80098 99 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 RHDQ02161 417 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 RAPGEF1Q13905 1077 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 IRF4Q15306 451 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 NR0B2Q15466 257 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 ALG11Q2TAA5 492 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 WSCD2Q2TBF2 565 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 LSMEM2Q8N112 164 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 DENND6BQ8NEG7 585 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 OR2AP1Q8NGE2 309 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 WBP1Q96G27 269 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 PPP1R16AQ96I34 528 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 CCDC114Q96M63 670 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 FOXP3Q9BZS1 431 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 ABCG4Q9H172 646 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 USP29Q9HBJ7 922 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 LHX3Q9UBR4 397 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 OR12D3Q9UGF7 316 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 LRRK1Q38SD2 2015 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 F8VZ95 297 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 AGRPO00253 132 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 KRIT1O00522 736 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 KDELR3O43731 214 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 TMCC1O94876 653 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 TNFSF15O95150 251 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 PIGNO95427 931 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 UCHL3P15374 230 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 MMP8P22894 467 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 ETV5P41161 510 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 RGRP47804 291 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 NFKB2Q00653 900 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 KLHL40Q2TBA0 621 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 ARL13BQ3SXY8 428 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 FOXR1Q6PIV2 292 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 ARCQ7LC44 396 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 PLA2G15Q8NCC3 412 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 PCDH19Q8TAB3 1148 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 HMCESQ96FZ2 354 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 EXOC2Q96KP1 924 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 EPAS1Q99814 870 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 DPH1Q9BZG8 443 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 THSD1Q9NS62 852 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 SPASTQ9UBP0 616 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 PADI4Q9UM07 663 aa10.98□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 FLNCQ14315 2725 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 B8ZZF3 427 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 POP4O95707 220 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 UNGP13051 313 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 C6P13671 934 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 ITGB6P18564 788 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 ARSDP51689 593 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 JAM2P57087 298 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 OGDHQ02218 1023 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 CCDC15Q0P6D6 951 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 SGCGQ13326 291 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 TMEM52BQ4KMG9 183 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 GDPD4Q6W3E5 623 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 MACC1Q6ZN28 852 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 CCL4L1Q8NHW4 92 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 RAB7BQ96AH8 199 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 CCDC74AQ96AQ1 378 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 IL12RB2Q99665 862 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 C11orf70Q9BRQ4 267 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 PDFQ9HBH1 243 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 SIRPGQ9P1W8 387 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 GULP1Q9UBP9 304 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
NISCH-206ENST00000474188 LRP4O75096 1905 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms