RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468915.5

SLC13A3-209, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-209ENST00000468915 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 GDF3Q9NR23 364 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 VPS45Q9NRW7 570 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM153AQ9UHL3 310 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 RAI2Q9Y5P3 530 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 V9GYY5 206 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ALOX15BO15296 676 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 USP12O75317 370 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 NEBLO76041 1014 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 DCNP07585 359 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 SERPINF2P08697 491 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ADCY8P40145 1251 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 CHRNA4P43681 627 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 TERF1P54274 439 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 GUCY2DQ02846 1103 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 MPP3Q13368 585 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 PTPRRQ15256 657 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 CRY1Q16526 586 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 SYT13Q7L8C5 426 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ARRDC3Q96B67 414 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 NEUROG2Q9H2A3 272 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 IL36AQ9UHA7 158 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa15□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 TSPAN11A1L157 253 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ANXA9O76027 345 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 AGTP01019 485 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 UGT2B4P06133 528 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 APRTP07741 180 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 TPSB2P20231 275 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ACTN2P35609 894 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ITGA8P53708 1063 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 GEMP55040 296 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 SATB1Q01826 763 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 E2F5Q15329 346 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 TPSAB1Q15661 275 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 TMIEQ8NEW7 156 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 IPMKQ8NFU5 416 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 OR2T3Q8NH03 318 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 SNF8Q96H20 258 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 APOL2Q9BQE5 337 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 WHRNQ9P202 907 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 CHKBQ9Y259 395 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 TMEM221A6NGB7 291 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 M0R296 226 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 SPINT1O43278 529 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 SOCS5O75159 536 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 PGLSO95336 258 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 AOC1P19801 751 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 MAPK8P45983 427 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 MTAPQ13126 283 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 NUMA1Q14980 2115 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 PCSK7Q16549 785 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 EOGTQ5NDL2 527 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 FLCNQ8NFG4 579 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ART4Q93070 314 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 LRRC45Q96CN5 670 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 FEM1CQ96JP0 617 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 PWWP2AQ96N64 755 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 FICDQ9BVA6 458 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 RAB17Q9H0T7 212 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 EML5Q05BV3 1969 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 PLK4O00444 970 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 EPOP01588 193 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC13A3-209ENST00000468915 ALADP13716 330 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms