RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464702.6

PDPK1-208, Transcript of 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1, human

TSL 2

Gene PDPK1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDPK1-208	ENST00000464702	ZNF131	P52739	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	TRAF1	Q13077	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	ESX1	Q8N693	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	HTRA1	Q92743	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	MROH8	Q9H579	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDPK1-208	ENST00000464702	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	IL1A	P01583	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	PGGT1B	P53609	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	KRT83	P78385	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	RPE65	Q16518	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	DUSP6	Q16828	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	CADM3	Q8N126	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	LHPP	Q9H008	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	CLIP1	P30622	1438 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702		A0A1B0GVT2	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	AHCYL1	O43865	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	CLDN7	O95471	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	TBX18	O95935	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	ADA	P00813	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	LIFR	P42702	1097 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	RFX2	P48378	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	ENTPD1	P49961	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	MMP14	P50281	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	PMS2	P54278	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	CDH12	P55289	794 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	BPIFB3	P59826	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	TRPC3	Q13507	836 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	CCNG2	Q16589	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	ME3	Q16798	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	SNX21	Q969T3	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702		A6NLC8	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDPK1-208	ENST00000464702		B4E171	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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