RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 NLRP9Q7RTR0 991 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB128Q7Z7B8 93 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TMC8Q8IU68 726 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 DNAAF3Q8N9W5 541 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 IPMKQ8NFU5 416 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 GPR150Q8NGU9 434 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 STYXQ8WUJ0 223 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 E2F7Q96AV8 911 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ALG14Q96F25 216 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM237Q96Q45 408 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PSKH2Q96QS6 385 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A12Q96S37 553 aa5.71□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZBP1Q9H171 429 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.71□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 NPHS2Q9NP85 383 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SAR1AQ9NR31 198 aa5.71□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF358Q9NW07 568 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SPG21Q9NZD8 308 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 COPG2Q9UBF2 871 aa5.71□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CAPN7Q9Y6W3 813 aa5.71□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 HEATR9A2RTY3 570 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 C2orf78A6NCI8 922 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 F5H5T6 163 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A4O43246 635 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 KDELR3O43731 214 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ITM2AO43736 263 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 BAIAP3O94812 1187 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 S1PR4O95977 384 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINE1P05121 402 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FGF1P05230 155 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 CD86P42081 329 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 ABCG1P45844 678 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SUOXP51687 545 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R39P59534 338 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MAXP61244 160 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RPS24P62847 133 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ2P63252 427 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 POU6F1Q14863 301 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 KRT72Q14CN4 511 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CYTH1Q15438 398 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CHI3L2Q15782 390 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CNGA3Q16281 694 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 MARC1Q5VT66 337 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ATG16L1Q676U5 607 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RFWD3Q6PCD5 774 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF783Q6ZMS7 281 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
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