RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 TLR4O00206 839 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 AQP7O14520 342 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM24O15164 1050 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC26A4O43511 780 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP2C2O75185 946 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 LY6G6DO95868 133 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 AMY2AP04746 511 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 FGRP09769 529 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM27P14373 513 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 AMY2BP19961 511 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 PDCP20941 246 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 MAPK10P53779 464 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 NXPH1P58417 271 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAM8P78325 824 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 HGFACQ04756 655 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 SPIDRQ14159 915 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 CEBPEQ15744 281 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 CENPPQ6IPU0 288 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 GUSBP11Q6P575 273 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 SCFD1Q8WVM8 642 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 USP7Q93009 1102 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 C14orf79Q96F83 325 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 RANBP9Q96S59 729 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 STRADBQ9C0K7 418 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 DENND4CQ5VZ89 1909 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 MTMR11A4FU01 709 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 STMND1H3BQB6 276 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 WNT9AO14904 365 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAMTS3O15072 1205 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 TULP3O75386 442 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 PEX11BO96011 259 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 IGHV4-34P06331 123 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ALPPL2P10696 532 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 PYGMP11217 842 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ATF6P18850 670 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 DGKAP23743 735 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 CD82P27701 267 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 SMARCA1P28370 1054 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ARID5AQ03989 594 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 UGCGQ16739 394 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP55Q53EZ4 464 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 FJX1Q86VR8 437 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP97Q8IW35 865 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 UBR7Q8N806 425 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF149Q8NC42 400 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 STKLD1Q8NE28 680 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 APPL2Q8NEU8 664 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC15Q8TF66 581 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 NRGNQ92686 78 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 UROC1Q96N76 676 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM206Q9H813 350 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 TLK1Q9UKI8 766 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 U3KQA8 63 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1W2PPC4 97 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1W2PR77 199 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms