RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RPS21P63220 83 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CCZ1BP86790 482 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ISXQ2M1V0 245 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ZNF284Q2VY69 593 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 C3orf38Q5JPI3 329 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 STRADAQ7RTN6 431 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 PARGQ86W56 976 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TMEM139Q8IV31 216 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CCDC185Q8N715 623 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 NAT6Q93015 286 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 FEM1CQ96JP0 617 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CHP1Q99653 195 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 IL12RB2Q99665 862 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 MYOCQ99972 504 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 PARVAQ9NVD7 372 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 UCKL1Q9NWZ5 548 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 K7ESM1 405 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TPP1O14773 563 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CSF2P04141 144 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 NME1P15531 152 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 NEK3P51956 506 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 METAP1P53582 386 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 HDAC4P56524 1084 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R38P59533 333 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ALFQ53S48 1182 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 RETSATQ6NUM9 610 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZSR6 202 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 OR13H1Q8NG92 308 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TRIM11Q96F44 468 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SLC46A1Q96NT5 459 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 HAPLN3Q96S86 360 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 IL36AQ9UHA7 158 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SATB2Q9UPW6 733 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CA5BQ9Y2D0 317 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 K7ENP7 123 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 FPGTO14772 594 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SLC28A2O43868 658 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SRCP12931 536 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 FECHP22830 423 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 OR1E1P30953 314 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ADRA1BP35368 520 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 INHBCP55103 352 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SLC20A2Q08357 652 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SGCGQ13326 291 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 MAMLD1Q13495 774 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 PTK2BQ14289 1009 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 NR0B2Q15466 257 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 EFHC2Q5JST6 749 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 HGSNATQ68CP4 663 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 GCNT7Q6ZNI0 430 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 BNIPLQ7Z465 357 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 DCAF4L2Q8NA75 395 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 OR52K2Q8NGK3 314 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 OR2A12Q8NGT7 310 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TTC9Q92623 222 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ALG14Q96F25 216 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 C1orf74Q96LT6 269 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CNPY3Q9BT09 278 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SLC17A9Q9BYT1 436 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 MAGEB5Q9BZ81 275 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 FAM117AQ9C073 453 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CEP44Q9C0F1 390 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 DEF6Q9H4E7 631 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SPASTQ9UBP0 616 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms