RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439004.1

C1orf140-202, Transcript of Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf140, Length 4,340 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140-202ENST00000439004 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa5.56□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 MAP2K7O14733 419 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TNFRSF10CO14798 259 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 OPA1O60313 960 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 LRRN2O75325 713 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 L1CAMP32004 1257 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 KCNMA1Q12791 1236 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 CAMK4Q16566 473 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TMEM211Q6ICI0 200 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TYW1BQ6NUM6 668 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 UGT3A1Q6NUS8 523 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 LCLAT1Q6UWP7 414 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 Q6ZSR6 202 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 NLRP9Q7RTR0 991 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 LUZP1Q86V48 1076 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 DEFB106AQ8N104 65 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 THAP4Q8WY91 577 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 USP7Q93009 1102 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 UCN3Q969E3 161 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 ZNF599Q96NL3 588 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TWSG1Q9GZX9 223 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 RAD54BQ9Y620 910 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 A0A1B0GUH1 482 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 PP2D1A8MPX8 630 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TTI1O43156 1089 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TRIM49P0CI25 452 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TRIM49CP0CI26 452 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 CYP11B1P15538 503 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 NASPP49321 788 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 ZNF165P49910 485 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 CSRP3P50461 194 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 MYL5Q02045 173 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 KCNC3Q14003 757 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TCEAL1Q15170 157 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 P3H1Q32P28 736 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 C4orf22Q6V702 233 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 MACC1Q6ZN28 852 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TMEM25Q86YD3 366 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 LINC00301Q8NCQ3 95 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 ASB12Q8WXK4 309 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 HMCESQ96FZ2 354 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 FCRL4Q96PJ5 515 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 STK33Q9BYT3 514 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TKTL2Q9H0I9 626 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 MYO1AQ9UBC5 1043 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 HCN2Q9UL51 889 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 ASXL3Q9C0F0 2248 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 CDC14CA4D256 554 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 RGSL1A5PLK6 1076 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TTC36A6NLP5 189 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 H0Y8X5 98 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 PPP1R37O75864 691 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 GFPT2O94808 682 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 PRAMEF12O95522 483 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 COX7A2P14406 83 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 ABOP16442 354 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 MAOBP27338 520 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 DAOAP59103 153 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 RPL26P61254 145 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 SERINC3Q13530 473 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 TRIM69Q86WT6 500 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 EPSTI1Q96J88 318 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 USP28Q96RU2 1077 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 MAP3K3Q99759 626 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 PIF1Q9H611 641 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf140-202ENST00000439004 SMYD3Q9H7B4 428 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms