RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR78Q96P69 363 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 FICDQ9BVA6 458 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 BCAP29Q9UHQ4 241 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 Q9Y3F1 56 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A2O15244 555 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA31D3P0C874 917 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXC8P31273 242 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf52Q5T4I8 152 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18.87■□□□□ 0.61
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 NDNQ99608 321 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ADA2Q9NZK5 511 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 LZTS1Q9Y250 596 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.87■□□□□ 0.61
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SH3BP1-202ENST00000417536 LRPAP1P30533 357 aa18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP1-202ENST00000417536 LSAMPQ13449 338 aa18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP1-202ENST00000417536 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP1-202ENST00000417536 POMKQ9H5K3 350 aa18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP1-202ENST00000417536 PADI3Q9ULW8 664 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TADA2AO75478 443 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 F9P00740 461 aa18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC1A2P43004 574 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R39P59534 338 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 HERC3Q15034 1050 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNU1A8MYU2 1149 aa18.85■□□□□ 0.61
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SH3BP1-202ENST00000417536 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TFAP2AP05549 437 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 COL6A2P12110 1019 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CLCNKBP51801 687 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PTK2BQ14289 1009 aa18.85■□□□□ 0.61
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SH3BP1-202ENST00000417536 HEXDCQ8WVB3 486 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF470Q6ECI4 717 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CNSTQ6PJW8 725 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TICAM1Q8IUC6 712 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF135Q8IUD6 432 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SRRDQ9UH36 339 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC160A6NGH7 325 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOT8O14734 319 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PMPCBO75439 489 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CAPN15O75808 1086 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SEPT6Q14141 434 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ATPAF2Q8N5M1 289 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CATSPER1Q8NEC5 780 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 HHLA1C9JL84 531 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 AURKAO14965 403 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMD3O43242 534 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL5P46777 297 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 COG7P83436 770 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 MYBPC1Q00872 1141 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CSHL1Q14406 222 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 DENND5AQ6IQ26 1287 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 LCA5Q86VQ0 697 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTN4Q8IWV2 1026 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP70Q8NHQ1 597 aa18.84■□□□□ 0.61
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