RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ADCY4Q8NFM4 1077 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SLC2A14Q8TDB8 520 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PALMDQ9NP74 551 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SYBUQ9NX95 663 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 HESX1Q9UBX0 185 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 NRCAMQ92823 1304 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CBFA2T3O75081 653 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 GPR32O75388 356 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SCNN1GP51170 649 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 RPS6KA2Q15349 733 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SURF1Q15526 300 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ARCQ7LC44 396 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PYROXD2Q8N2H3 581 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 OR52K1Q8NGK4 314 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 HTRA1Q92743 480 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 RTKNQ9BST9 563 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 E7ESA3 106 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 M0QZ92 97 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 TRIM13O60858 407 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 IL18RAPO95256 599 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF23P17027 643 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 GRK2P25098 689 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SDC4P31431 198 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 BCAP31P51572 246 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SLC7A2P52569 658 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 TUBB3Q13509 450 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 IKBKEQ14164 716 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SPPL2CQ8IUH8 684 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 BBS5Q8N3I7 341 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 VCPIP1Q96JH7 1222 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ADAMTS10Q9H324 1103 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CHST12Q9NRB3 414 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 IPPQ9Y573 584 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 NME7Q9Y5B8 376 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 WDR90Q96KV7 1748 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SCN1AP35498 2009 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 TRIP11Q15643 1979 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 KPNA7A9QM74 516 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 DENRO43583 198 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CILPO75339 1184 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 BCL10O95999 233 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 NDUFV1P49821 464 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SERPINB9P50453 376 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CLCN2P51788 898 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 TPTEP56180 551 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 XIAPP98170 497 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 NOMO1Q15155 1222 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 IMPG1Q17R60 797 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 WSCD1Q658N2 575 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SLC15A4Q8N697 577 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 BEST2Q8NFU1 509 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 KCTD4Q8WVF5 259 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 MFSD3Q96ES6 412 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ITM2CQ9NQX7 267 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 DCDC2Q9UHG0 476 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 RIMS3Q9UJD0 308 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.08□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SOCS2O14508 198 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 INPP4BO15327 924 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 F2P00734 622 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ASGR1P07306 291 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 TFEBP19484 476 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CYP2F1P24903 491 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PSMB4P28070 264 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 CPT1AP50416 773 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PMS2P3Q13401 168 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 SH2D5Q6ZV89 423 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ACVR1CQ8NER5 493 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 RNF157Q96PX1 679 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 OSBPL11Q9BXB4 747 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 NMRAL1Q9HBL8 299 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PNPLA3Q9NST1 481 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 GON4LQ3T8J9 2241 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 GPD1P21695 349 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 BMXP51813 675 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 ARPP19P56211 112 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 SULT2A1Q06520 285 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-202ENST00000409251 DGCR6Q14129 220 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms