RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 PIRTP0C851 137 aa20.35■□□□□ 0.85
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ODC1-202ENST00000405333 KDSRQ06136 332 aa20.35■□□□□ 0.85
ODC1-202ENST00000405333 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF366Q8N895 744 aa20.32■□□□□ 0.84
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ODC1-202ENST00000405333 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 DEC1Q9P2X7 70 aa20.32■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.32■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 TTC34A8MYJ7 566 aa20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ECI2O75521 394 aa20.31■□□□□ 0.84
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