RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 TRIM38O00635 465 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 VILLO15195 856 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SPTLC2O15270 562 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TMPRSS2O15393 492 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 KLK10O43240 276 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 RTN2O75298 545 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MT-CO3P00414 261 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CALCAP01258 141 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 IL1BP01584 269 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 IGLV3-19P01714 112 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NR3C1P04150 777 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D3HP0C7X1 549 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CD19P15391 556 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PRLRP16471 622 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ITIH2P19823 946 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SYT1P21579 422 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 COL8A1P27658 744 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SLC6A4P31645 630 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NTF4P34130 210 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ACTN2P35609 894 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CSKP41240 450 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 GALCP54803 685 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ST8SIA6P61647 398 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 LRMPQ12912 555 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NFATC3Q12968 1075 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CDH18Q13634 790 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 KCNJ12Q14500 433 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 GRM3Q14832 879 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SLC9A5Q14940 896 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CST6Q15828 149 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D25Q3MII6 688 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ZACNQ401N2 412 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MPPE1Q53F39 396 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ALFQ53S48 1182 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 BROXQ5VW32 411 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SHC4Q6S5L8 630 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 UNC13DQ70J99 1090 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MFN1Q8IWA4 741 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CRYBG2Q8N1P7 616 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 STK40Q8N2I9 435 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NXPE1Q8N323 547 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 AADATQ8N5Z0 425 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ANKRD42Q8N9B4 389 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CHST14Q8NCH0 376 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 UBA3Q8TBC4 463 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SAP25Q8TEE9 199 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NUDT8Q8WV74 236 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 KCNE4Q8WWG9 221 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 FAXDC2Q96IV6 333 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ASPNQ9BXN1 380 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 DCLK3Q9C098 648 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM245Q9H330 911 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CLMPQ9H6B4 373 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SGK2Q9HBY8 427 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 FZD3Q9NPG1 666 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 EXOC1Q9NV70 894 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 COMMD8Q9NX08 183 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MKS1Q9NXB0 559 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 RNF112Q9ULX5 631 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SCINQ9Y6U3 715 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 UBE4BO95155 1302 aa4.92□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms