RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 PTPRRQ15256 657 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 RAB30Q15771 203 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 LY6G5CQ5SRR4 150 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 RNF43Q68DV7 783 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 NAT16Q8N8M0 369 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 BANPQ8N9N5 519 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 MYLIPQ8WY64 445 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TRIB3Q96RU7 358 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SPHK2Q9NRA0 654 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TREX1Q9NSU2 369 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SENP1Q9P0U3 644 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 A6NNZ2 444 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 KRT38O76015 456 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 BMP1P13497 986 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CA4P22748 312 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ARNTP27540 789 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TUBB8Q3ZCM7 444 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 STRA8Q7Z7C7 330 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 DCAF4L2Q8NA75 395 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FEM1CQ96JP0 617 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 BBS2Q9BXC9 721 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 LMAN2LQ9H0V9 348 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 EPN3Q9H201 632 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.5■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SOBPA7XYQ1 873 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GLP2RO95838 553 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 POU2F2P09086 479 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TYRP14679 529 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GMPRP36959 345 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 STK19P49842 368 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 RHOAP61586 193 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SLC18A2Q05940 514 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 USP4Q13107 963 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 LGSNQ5TDP6 509 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 NCEH1Q6PIU2 408 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TCP10LQ8TDR4 215 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FAM107BQ9H098 131 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PRKAG3Q9UGI9 489 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 RAI2Q9Y5P3 530 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ARL5AQ9Y689 179 aa15.49■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0U1RQS6 177 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GMNCA6NCL1 334 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 AURKAO14965 403 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 LDB2O43679 373 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 EPOP01588 193 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ITGA2BP08514 1039 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GKP32189 559 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SLC8A1P32418 973 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SERPINB9P50453 376 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TMPRSS15P98073 1019 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TRAF2Q12933 501 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 CTBP1Q13363 440 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TSTD2Q5T7W7 516 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 BCAS4Q8TDM0 211 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SLC13A1Q9BZW2 595 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 TNKS2Q9H2K2 1166 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 HEATR9A2RTY3 570 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ERICH4A6NGS2 130 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ASMTLO95671 621 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 NDST3O95803 873 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 GABRB3P28472 473 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PGGT1BP53609 377 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 HYAL1Q12794 435 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FUT11Q495W5 492 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 RETSATQ6NUM9 610 aa15.48■□□□□ 0.07
CASQ1-201ENST00000368078 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.2 ms