RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367740.2

VAMP4-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-202ENST00000367740 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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VAMP4-202ENST00000367740 PDCP20941 246 aa14.85□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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VAMP4-202ENST00000367740 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 TTLL8A6PVC2 850 aa14.84□□□□□ -0.03
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VAMP4-202ENST00000367740 C5orf22Q49AR2 442 aa14.84□□□□□ -0.03
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VAMP4-202ENST00000367740 ALFQ53S48 1182 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 STARD8Q92502 1023 aa14.84□□□□□ -0.03
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VAMP4-202ENST00000367740 PDXPQ96GD0 296 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 HAPLN3Q96S86 360 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.84□□□□□ -0.03
VAMP4-202ENST00000367740 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
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VAMP4-202ENST00000367740 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.84□□□□□ -0.03
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VAMP4-202ENST00000367740 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.84□□□□□ -0.03
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VAMP4-202ENST00000367740 TMEM270Q6UE05 265 aa14.83□□□□□ -0.04
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VAMP4-202ENST00000367740 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
VAMP4-202ENST00000367740 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.83□□□□□ -0.04
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VAMP4-202ENST00000367740 C16orf46Q6P387 395 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP4-202ENST00000367740 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP4-202ENST00000367740 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP4-202ENST00000367740 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
VAMP4-202ENST00000367740 TCTN2Q96GX1 697 aa14.82□□□□□ -0.04
VAMP4-202ENST00000367740 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.82□□□□□ -0.04
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VAMP4-202ENST00000367740 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.82□□□□□ -0.04
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