RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFB5O43674 189 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEC1O60732 1142 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 BANF1O75531 89 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FTH1P02794 183 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 VAV1P15498 845 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1C1P21283 382 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 GABRB2P47870 512 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PSME3P61289 254 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ARMC4Q5T2S8 1044 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF605Q86T29 641 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PWWP2AQ96N64 755 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NDOR1Q9UHB4 597 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MROH2AA6NES4 1674 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 BRCC3P46736 316 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CTBP1Q13363 440 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 DGKZQ13574 1117 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SPIDRQ14159 915 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NOMO1Q15155 1222 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TTC23Q5W5X9 447 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MACC1Q6ZN28 852 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FIBCD1Q8N539 461 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 HDAC10Q969S8 669 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SNX15Q9NRS6 342 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 OTCP00480 354 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PACS1Q6VY07 963 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RHBDL2Q9NX52 303 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 HGFP14210 728 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 GPR1P46091 355 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RAB14P61106 215 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TREML2Q5T2D2 321 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO30Q8TB52 745 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PIRTP0C851 137 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 IGFLR1Q9H665 355 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 VWA7Q9Y334 891 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FAM25AB3EWG3 89 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FAM25CB3EWG5 89 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FAM25GB3EWG6 89 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CDYL2Q8N8U2 506 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC2Q96KP1 924 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 COPS8Q99627 209 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CDC73Q6P1J9 531 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MIEF2Q96C03 454 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CTSEP14091 401 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 GRIA3P42263 894 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 VSTM1Q6UX27 236 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FAM84AQ96KN4 292 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CPXM1Q96SM3 734 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TRMOQ9BU70 441 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FAIM2Q9BWQ8 316 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MYL12BO14950 172 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ITGA1P56199 1179 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 GSTA3Q16772 222 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CLYBLQ8N0X4 340 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 OR4L1Q8NH43 312 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RHOJQ9H4E5 214 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SATB2Q9UPW6 733 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PIAS1O75925 651 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CRATP43155 626 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 POLD2P49005 469 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SERHL2Q9H4I8 314 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 GLOD4Q9HC38 313 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SERHLQ9NQF3 203 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CILPO75339 1184 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms