RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 PSKH2Q96QS6 385 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 SOX13Q9UN79 622 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 RFPL1O75677 317 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 DCTN3O75935 186 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 USP1O94782 785 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 PRAMEF12O95522 483 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.853e-9■□□□□ 9.4
SUMO3-201ENST00000332859 TPH1P17752 444 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 ARF5P84085 180 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 MGAT5Q09328 741 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 SLC14A2Q15849 920 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF77Q15935 545 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 FITM2Q8N6M3 262 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-201ENST00000332859 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 KLF11O14901 512 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 MUSKO15146 869 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ZMPSTE24O75844 475 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 KCNC3Q14003 757 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 SETDB1Q15047 1291 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 PCID2Q5JVF3 399 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ARMC3Q5W041 872 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 POTEHQ6S545 545 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 TMEM135Q86UB9 458 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 RIN3Q8TB24 985 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 C10orf82Q8WW14 230 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 PLLPQ9Y342 182 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 SNAP91O60641 907 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 UGT1A9O60656 530 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 FIBINQ8TAL6 211 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ITFG1Q8TB96 612 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ALG14Q96F25 216 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.32■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 WDR91A4D1P6 747 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 SERPINF2P08697 491 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 CES1P23141 567 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 SERPINB4P48594 390 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 CYTH1Q15438 398 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 KIFC1Q9BW19 673 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ECT2Q9H8V3 914 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 PLK2Q9NYY3 685 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 VPS51Q9UID3 782 aa20.31■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 TGDSO95455 350 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 WEE1P30291 646 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 CRHR1P34998 444 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 NCALDP61601 193 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 OTUB2Q96DC9 234 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 IFT43Q96FT9 208 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 CERS2Q96G23 380 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 FEM1CQ96JP0 617 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 GGT7Q9UJ14 662 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 MYO7AQ13402 2215 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 HMX2A2RU54 273 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 ATP5HO75947 161 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 TMCC1O94876 653 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 LMAN2Q12907 356 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 SLC12A1Q13621 1099 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 BMPR2Q13873 1038 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 IHHQ14623 411 aa20.3■□□□□ 0.84
SUMO3-201ENST00000332859 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms