RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 MAXP61244 160 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM32Q13049 653 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CNSTQ6PJW8 725 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RDH11Q8TC12 318 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RTKNQ9BST9 563 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 EBF3Q9H4W6 596 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MIA3Q5JRA6 1907 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MYO16Q9Y6X6 1858 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0U1RQF3 1178 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF623O75123 536 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ETS2P15036 469 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ARSAP15289 507 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HOXC13P31276 330 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GPR15P49685 360 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MTTPP55157 894 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TUSC3Q13454 348 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RANBP10Q6VN20 620 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RRAGCQ9HB90 399 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TREX1Q9NSU2 369 aa16.53■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GEMP55040 296 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TSPY1Q01534 308 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 LPIN1Q14693 890 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SFT2D3Q587I9 215 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 LCA5Q86VQ0 697 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RNF135Q8IUD6 432 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 THEM5Q8N1Q8 247 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SCML4Q8N228 414 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 MID2Q9UJV3 735 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 CCL22O00626 93 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 RAG1P15918 1043 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PAX3P23760 479 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJB2P25686 324 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PEX2P28328 305 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PRDX6P30041 224 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PRKAA1Q13131 559 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 IHHQ14623 411 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 UGP2Q16851 508 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 GBP5Q96PP8 586 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 FIS1Q9Y3D6 152 aa16.52■□□□□ 0.24
SHQ1-201ENST00000325599 J3KR12 359 aa16.52■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 WNT3AP56704 352 aa16.52■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 DDR2Q16832 855 aa16.52■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 POTEHQ6S545 545 aa16.52■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.52■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 RNF148Q8N7C7 305 aa16.52■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.52■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.52■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 PATJQ8NI35 1801 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA31D3P0C874 917 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 CSHL1Q14406 222 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 DSC3Q14574 896 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 DSELQ8IZU8 1212 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 LZTR1Q8N653 840 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 GPR152Q8TDT2 470 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 TRIB2Q92519 343 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 RCN3Q96D15 328 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 H3BNX3 289 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 THRAP10827 490 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 KCNA5P22460 613 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 ITKQ08881 620 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 AFMIDQ63HM1 303 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 NEPROQ6NW34 567 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 KDM1BQ8NB78 822 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 SOCS4Q8WXH5 440 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 IFT43Q96FT9 208 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 SUSD3Q96L08 255 aa16.51■□□□□ 0.23
SHQ1-201ENST00000325599 CDRT15Q96T59 188 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms