RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHPFQ8IZ52 775 aa27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A41Q8N5S1 370 aa27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF366Q8N895 744 aa27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2A12Q8NGT7 310 aa27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAVIN3Q969G5 261 aa27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEPHQ9BQS7 1158 aa27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRE3Q9BY15 652 aa27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 BFARQ9NZS9 450 aa27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 C19orf67A6NJJ6 358 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 AVILO75366 819 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 EGFP01133 1207 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTM1Q13496 603 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 EMC10Q5UCC4 262 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDE2Q6IQ49 451 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 FSTL4Q6MZW2 842 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 RANBP10Q6VN20 620 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNV2Q8TDN2 545 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM245Q9H330 911 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHKBQ9Y259 395 aa27.7■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOCS5O75159 536 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDST3O95803 873 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-EP13747 358 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-DPA1P20036 260 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIE1P35590 1138 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 IHHQ14623 411 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFAP58Q5T655 872 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARMC12Q5T9G4 340 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF534Q76KX8 674 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPRN2Q92932 1015 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXL21Q9UKT6 434 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO10Q9HD67 2058 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL4A2P08572 1712 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDR42E2A6NKP2 422 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL12RB1P42701 662 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPY2RP49146 381 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAF2Q12933 501 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC1A5Q15758 541 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 IER5LQ5T953 404 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMC3Q7Z5M5 1100 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAMK1DQ8IU85 385 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBED8Q8IZ13 594 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 RMDN1Q96DB5 314 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC39Q96DD0 335 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASB2Q96Q27 587 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTG2Q9H4K7 406 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL36AQ9UHA7 158 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CA14Q9ULX7 337 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 STON1Q9Y6Q2 735 aa27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 WASH3PC4AMC7 463 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGNO95427 931 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGF1P05230 155 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHX1P07099 455 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 GKP32189 559 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGEA4P43358 317 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHB1P54762 984 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKCQQ04759 706 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO43Q4G163 708 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASC4Q6P4E1 433 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF852Q6ZMS4 543 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHST14Q8NCH0 376 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PYROXD1Q8WU10 500 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8D1Q8WZ84 308 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 NSMCE3Q96MG7 304 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARNT2Q9HBZ2 717 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC80Q8N2C7 3258 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 E7ESA3 106 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPP00450 1065 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKCHP24723 683 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGAT1P26572 445 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGEA3P43357 314 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHRNA4P43681 627 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PMS2P54278 862 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSS51Q4VC12 460 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 C2orf27AQ580R0 203 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIRPB2Q5JXA9 342 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRIG1Q96JA1 1093 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACOX2Q99424 681 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUV39H2Q9H5I1 410 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF3Q9NR81 526 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAMD15Q9P1V8 674 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALOX15BO15296 676 aa27.66■■■□□ 2.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 BMP1P13497 986 aa27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms