RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 DUSP4Q13115 394 aa24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MTA1Q13330 715 aa24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 NADSYN1Q6IA69 706 aa24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 POU5F2Q8N7G0 328 aa24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ARRDC2Q8TBH0 407 aa24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 STOML1Q9UBI4 398 aa24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 AURKAO14965 403 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 HOXA2O43364 376 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TACR2P21452 398 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ETFBP38117 255 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 PBX3P40426 434 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ASPHQ12797 758 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 IHHQ14623 411 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 LBRQ14739 615 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 CNSTQ6PJW8 725 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MAPK15Q8TD08 544 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 GIPC2Q8TF65 315 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 OMDQ99983 421 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 DLX3O60479 287 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 PIGNO95427 931 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 RPL14P50914 215 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 CLCN5P51795 746 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 NAGLUP54802 743 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 PRKAA1Q13131 559 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC6Q16204 474 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 SIRPB2Q5JXA9 342 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 C6orf163Q5TEZ5 329 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TMCO4Q5TGY1 634 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TMC7Q7Z402 723 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 OR13J1Q8NGT2 312 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 CMTM5Q96DZ9 223 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 CLPTM1LQ96KA5 538 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TTPALQ9BTX7 342 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 CREBZFQ9NS37 354 aa24.17■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 SLC38A8A6NNN8 435 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 E9PBE3 544 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 F8W8V4 182 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MATN2O00339 956 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL41O60662 606 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 GALTP07902 379 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ACVRL1P37023 503 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 METTL21CQ5VZV1 264 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 SPATA6LQ8N4H0 392 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MOCOSQ96EN8 888 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MYEOVQ96EZ4 313 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TCF7L2Q9NQB0 619 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ACSS2Q9NR19 701 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MAN1C1Q9NR34 630 aa24.16■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 F5H5T6 163 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 HDAC3O15379 428 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 DCXO43602 365 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 PRAMEF11O60813 436 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 GNRH1P01148 92 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ATF6P18850 670 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ELF1P32519 619 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 CCR10P46092 362 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TAF11Q15544 211 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 GALNT7Q86SF2 657 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 NDNQ99608 321 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 SLC7A8Q9UHI5 535 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MROH6A6NGR9 719 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TBKBP1A7MCY6 615 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 SLC7A4O43246 635 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 PRDX6P30041 224 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF235Q14590 738 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TCTN1Q2MV58 587 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF789Q5FWF6 425 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 LGI2Q8N0V4 545 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 HEXDCQ8WVB3 486 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TSPAN17Q96FV3 270 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 OR52B2Q96RD2 323 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TTLL2Q9BWV7 592 aa24.15■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms