RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 GABREP78334 506 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 UBXN1Q04323 297 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJC24Q6P3W2 148 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 CXorf40AQ8TE69 158 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 HMCESQ96FZ2 354 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 MCEEQ96PE7 176 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 AGPAT1Q99943 283 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 SPASTQ9UBP0 616 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 FZD10Q9ULW2 581 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 LOC400499M0QZD8 3231 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 TPP1O14773 563 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 TGM2P21980 687 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 YPEL5P62699 121 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 TLE3Q04726 772 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 SERINC3Q13530 473 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 GUSBP11Q6P575 273 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 SPACA3Q8IXA5 215 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 LSMEM2Q8N112 164 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 LGMNQ99538 433 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 EPAS1Q99814 870 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 DKK3Q9UBP4 350 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 SHROOM3Q8TF72 1996 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 FASNP49327 2511 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 WASH4PA8MWX3 477 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 INSIG1O15503 277 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 GCATO75600 419 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 TIMP2P16035 220 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 LSSP48449 732 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 AIF1P55008 147 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 MYL5Q02045 173 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf61Q13536 156 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 ISXQ2M1V0 245 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 KLHL40Q2TBA0 621 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 PARP15Q460N3 678 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 PRRT3Q5FWE3 981 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 PHACTR4Q8IZ21 702 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF248Q8NDW4 579 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 EXOC2Q96KP1 924 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 ERGIC2Q96RQ1 377 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 CNPY3Q9BT09 278 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 LHX3Q9UBR4 397 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 DXOO77932 396 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 XPAP23025 273 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 ADKP55263 362 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 CYTH1Q15438 398 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 NR0B2Q15466 257 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 FAXCQ5TGI0 409 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 DCUN1D2Q6PH85 259 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 CRTC1Q6UUV9 634 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 NCAPGQ9BPX3 1015 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC61Q9BV99 259 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 BOCQ9BWV1 1114 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 SLC13A1Q9BZW2 595 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 ANO10Q9NW15 660 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC10BA6NIK2 292 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 TOR1BO14657 336 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 MUSKO15146 869 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 PIGNO95427 931 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 PRB1P04280 392 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 ANXA6P08133 673 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 CXADRP78310 365 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 ELP6Q0PNE2 266 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM52BQ4KMG9 183 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 PERM1Q5SV97 790 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 ACAD10Q6JQN1 1059 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 MACC1Q6ZN28 852 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 GPR155Q7Z3F1 870 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 MCOLN2Q8IZK6 566 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 SLC39A7Q92504 469 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 GLMNQ92990 594 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 HIC2Q96JB3 615 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL3-201ENST00000296026 TBATAQ96M53 351 aa19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms