RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.58■□□□□ 0.24
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HOXD3-201ENST00000249440 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.56■□□□□ 0.24
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HOXD3-201ENST00000249440 WNT3AP56704 352 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 CAP1Q01518 475 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 PCSK7Q16549 785 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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HOXD3-201ENST00000249440 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 IGSF5Q9NSI5 407 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 FNIP2Q9P278 1114 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
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